New England Biolabs
To access your account, log in or register.
Products Technical Reference Customer Service My NEB Account
shopping cart | log in
Contact NEB About Us Site Map Request a Catalog OEM at NEB International Orders Freezer Program Quick Order
Related Information
Request Technical Support
Favorite Tools
Enzyme Finder
NEBcutter
NEBuffer Chart
Double Digest Finder
PCR Selection Tool
Isoschizomers
DNA Sequences
and Maps
REBASE
Home >  Technical Reference > Restriction Endonucleases > Recognition Specificities
Alphabetized List of Recognition Specificities

All restriction endonuclease recognition specificities available from New England Biolabs are listed below. All recognition sequences are written 5´ to 3´ using the single letter code nomenclature with the point of cleavage indicated by a "/". Numbers in parentheses indicate point of cleaveage for non-palindromic enzymes.

For example, GGTCTC(1/5) indicates cleavage at:
5´ ...GGTCTCN/...3´
3´ ...CCAGAGNNNNN/...5´

Recognition SequenceEnzyme
AA/CGTTAclI  
A/AGCTTHindIII  
AAT/ATTSspI  SspI-HF™  
/AATTTsp509I  
A/CATGTPciI  
A/CCGGTAgeI  
ACCTGC(4/8)BspMI  BfuAI  
A/CCWGGTSexAI  
A/CGCGTMluI  
ACGGC(12/14)BceAI  
A/CGTHpyCH4IV  
ACN/GTHpyCH4III  
(10/15)ACNNNNGTAYC(12/7)BaeI  
(9/12)ACNNNNNCTCC(10/7)BsaXI  
A/CRYGTAflIII  
A/CTAGTSpeI  
ACTGG(1/-1)BsrI  
ACTGGG(5/4)BmrI  
A/GATCTBglII  
AGC/GCTAfeI  
AG/CTAluI  
AGG/CCTStuI  
AGT/ACTScaI  ScaI-HF™  
AT/CGATBspDI  ClaI  
ATCTATGTCGGGTGCGGAGAAAGAGGTAAT(-15/-19)PI-SceI  
ATGCA/TNsiI  
AT/TAATAseI  
ATTT/AAATSwaI  
(11/13)CAANNNNNGTGG(12/10)CspCI  
C/AATTGMfeI  MfeI-HF™  
CACGAG(-5/-1)BssSI  
CACGTC(-3/-3)BmgBI  
CAC/GTGPmlI  
CACNNN/GTGDraIII  
CACNN/NNGTGAleI  
CAGCAG(25/27)EcoP15I  
CAG/CTGPvuII  PvuII-HF™  
CAGNNN/CTGAlwNI  
NNCASTGNN/TspRI  
CA/TATGNdeI  
/CATGFatI  
C/ATGCviAII  
CATG/NlaIII  
CAYNN/NNRTGMslI  
CCANNNNN/NNNNTGGXcmI  
CCANNNNN/NTGGBstXI  
CCANNNN/NTGGPflMI  
CCATC(4/5)BccI  
C/CATGGNcoI  NcoI-HF™  
CCCAGC(-5/-1)BseYI  
CCCGC(4/6)FauI  
C/CCGGGTspMI  XmaI  
CCC/GGGSmaI  
(0/-1)CCDNt.CviPII  
CCGC(-3/-1)AciI  
CCGC/GGSacII  
CCGCTC(-3/-3)BsrBI  
C/CGGHpaII  MspI  
/CCNGGBssKI  
CC/NGGScrFI  
/CCNGGStyD4I  
C/CNNGGBsaJI  
CCNNNNN/NNGGBslI  
C/CRYGGBtgI  
CC/SGGNciI  
C/CTAGGAvrII  
CCTC(7/6)MnlI  
CCTCAGCNb.BbvCI  
CCTCAGC(-5/-2)BbvCI  
CCTCAGC(-5/-7)Nt.BbvCI  
CCTGCA/GGSbfI  SbfI-HF™  
CCTNAGC(-5/-2)Bpu10I  
CC/TNAGGBsu36I  
CCTNN/NNNAGGEcoNI  
CCTTC(6/5)HpyAV  
CC/WGGBstNI  
/CCWGGPspGI  
C/CWWGGStyI  
(10/12)CGANNNNNNTGC(12/10)BcgI  
CGAT/CGPvuI  
CG/CGBstUI  
C/GGCCGEagI  EagI-HF™  
CG/GWCCGRsrII  
CGRY/CGBsiEI  
CGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAA(-9/-13)I-CeuI  
C/GTACGBsiWI  
CGTCTC(1/5)BsmBI  
CGWCG/Hpy99I  
CMG/CKGMspA1I  
CR/CCGGYGSgrAI  
C/TAGBfaI  
CTCAG(9/7)BspCNI  
C/TCGAGTliI  XhoI  PaeR7I  
CTCTTC(1/4)EarI  
CTGAAG(16/14)AcuI  
CTGCA/GPstI  
CTGGAG(16/14)BpmI  
C/TNAGDdeI  
C/TRYAGSfcI  
C/TTAAGAflII  
CTTGAG(16/14)BpuEI  
C/TYRAGSmlI  
C/YCGRGBsoBI  AvaI  
GAAGA(8/7)MboII  
GAAGAC(2/6)BbsI  
GAANN/NNTTCXmnI  
GAATGC(1/-1)BsmI  
GAATGCNb.BsmI  
G/AATTCEcoRI  EcoRI-HF™  
GACGC(5/10)HgaI  
GACGT/CAatII  
GAC/GTCZraI  
GACN/NNGTCTth111I  PflFI  
GACNN/NNGTCPshAI  
GACNNN/NNGTCAhdI  
GACNNNN/NNGTCDrdI  
GAG/CTCEco53kI  
GAGCT/CSacI  SacI-HF™  
GAGGAG(10/8)BseRI  
GAGTC(4/-5)Nt.BstNBI  
GAGTC(4/5)PleI  
GAGTC(5/5)MlyI  
G/ANTCHinfI  
GAT/ATCEcoRV  EcoRV-HF™  
/GATCDpnII  MboI  
GA/TCDpnI  
/GATCSau3AI  BfuCI  
GATNN/NNATCBsaBI  
G/AWTCTfiI  
GCAATG(2/0)BsrDI  
GCAATGNb.BsrDI  
GCAGC(8/12)BbvI  
GCAGTG(2/0)BtsI  
GCAGTGNb.BtsI  
GCANNNN/NTGCBstAPI  
GCATC(5/9)SfaNI  
GCATG/CSphI  SphI-HF™  
GCCGAG(21/19)NmeAIII  
GCC/GGCNaeI  
G/CCGGCNgoMIV  
GCCNNNN/NGGCBglI  
GCGAT/CGCAsiSI  
GCGATG(10/14)BtgZI  
G/CGCHinP1I  
GCG/CHhaI  
G/CGCGCBssHII  
GC/GGCCGCNotI  NotI-HF™  
GC/NGCFnu4HI  
GCN/NGCCac8I  
GCNNNNN/NNGCMwoI  
G/CTAGCNheI  NheI-HF™  
GCTAG/CBmtI  
GCTCTTC(1/-7)Nt.BspQI  
GCTCTTC(1/4)SapI  BspQI  
GC/TNAGCBlpI  
G/CWGCTseI  ApeKI  
GDGCH/CBsp1286I  
GGATC(4/-5)Nt.AlwI  
GGATC(4/5)AlwI  
G/GATCCBamHI  BamHI-HF™  
GGATG(2/0)BtsCI  
GGATG(9/13)FokI  
GG/CCHaeIII  PhoI  
GGCCGG/CCFseI  
GGCCNNNN/NGGCCSfiI  
GGC/GCCSfoI  
GG/CGCCNarI  
G/GCGCCKasI  
GG/CGCGCCAscI  
GGCGGA(11/9)EciI  
GGGAC(10/14)BsmFI  
G/GGCCCPspOMI  
GGGCC/CApaI  
G/GNCCSau96I  
GGN/NCCNlaIV  
G/GTACCAcc65I  
GGTAC/CKpnI  
GGTCTC(1/5)BsaI  
GGTGA(8/7)HphI  
G/GTNACCBstEII  
G/GWCCAvaII  
G/GYRCCBanI  
GKGCM/CBaeGI  
GR/CGYCBsaHI  
GRGCY/CBanII  
G/TACCviQI  
GT/ACRsaI  
GTA/TACBstZ17I  
GTATCC(6/5)BciVI  
G/TCGACSalI  SalI-HF™  
GTCTC(1/-5)Nt.BsmAI  
GTCTC(1/5)BsmAI  
G/TGCACApaLI  
GTGCAG(16/14)BsgI  
GT/MKACAccI  
GTN/NACHpy166II  
/GTSACTsp45I  
GTT/AACHpaI  
GTTT/AAACPmeI  
GTY/RACHincII  
GWGCW/CBsiHKAI  
R/AATTYApoI  
RCATG/YNspI  
R/CCGGYBsrFI  
R/GATCYBstYI  
RGCGC/YHaeII  
RG/CYCviKI-1  
RG/GNCCYEcoO109I  
RG/GWCCYPpuMI  
TAC/GTASnaBI  
TAGGGATAACAGGGTAAT(-9/-13)I-SceI  
T/CATGABspHI  
T/CCGGABspEI  
TCCRAC(20/18)MmeI  
T/CGATaqαI  
TCG/CGANruI  
TCN/GAHpy188I  
TC/NNGAHpy188III  
T/CTAGAXbaI  
T/GATCABclI  
TG/CAHpyCH4V  
TGC/GCAFspI  
TGGCAAACAGCTATTATGGGTATTATGGGT(-13/-17)PI-PspI  
TGG/CCAMscI  
T/GTACABsrGI  
T/TAAMseI  
TTAAT/TAAPacI  
TTA/TAAPsiI  
TT/CGAABstBI  
TTT/AAADraI  
VC/TCGAGBPspXI  
W/CCGGWBsaWI  
YAC/GTRBsaAI  
Y/GGCCREaeI